Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms