Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CACNA1BQ00975 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms