Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms