Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBX1P83916 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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