Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP46P62068 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP46P62068 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
USP46P62068 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP46P62068 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP46P62068 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP46P62068 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP46P62068 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP46P62068 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
USP46P62068 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP46P62068 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP46P62068 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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