Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBASH3AP57075 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms