Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPN5P54829 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms