Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCA2P51587 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms