Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms