Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDH1P40925 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MDH1P40925 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MDH1P40925 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MDH1P40925 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MDH1P40925 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MDH1P40925 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MDH1P40925 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MDH1P40925 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MDH1P40925 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MDH1P40925 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MDH1P40925 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
MDH1P40925 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MDH1P40925 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MDH1P40925 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms