Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms