Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA13P31271 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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HOXA13P31271 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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HOXA13P31271 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA13P31271 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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