Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMBRP28336 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMBRP28336 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMBRP28336 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NMBRP28336 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMBRP28336 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NMBRP28336 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NMBRP28336 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NMBRP28336 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms