Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NFKBIAP25963 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms