Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NELFEP18615 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NELFEP18615 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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