Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms