Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BRAFP15056 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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