Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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