Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOA4P06727 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA4P06727 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA4P06727 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms