Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms