Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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LTAP01374 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LTAP01374 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LTAP01374 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LTAP01374 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LTAP01374 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LTAP01374 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LTAP01374 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LTAP01374 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LTAP01374 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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