Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC9O60706 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms