Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMAD6O43541 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD6O43541 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD6O43541 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD6O43541 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD6O43541 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms