Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms