Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms