Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PPP3CB-203ENST00000394828 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VGLL3A8MV65 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 KLF17-201ENST00000372299 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 IL17REL-202ENST00000389983 3668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VGLL3A8MV65 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VGLL3A8MV65 DERL1-201ENST00000259512 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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