Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSDA5PKW4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms