Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA6A0AVT1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms