Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YBX2Q9Y2T7 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms