Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAN1Q9Y2M0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms