Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L1RE1Q9UN81 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms