Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RABGEF1Q9UJ41 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RABGEF1Q9UJ41 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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