Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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