Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms