Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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SEMA4BQ9NPR2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4BQ9NPR2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4BQ9NPR2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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