Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms