Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms