Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008412.1-201ENST00000521552 588 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 PGA3-207ENST00000543125 968 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025030.1-201ENST00000548007 573 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01588-213ENST00000557142 492 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEACAM5-209ENST00000616453 1160 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E22P-202ENST00000641331 1154 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E22P-203ENST00000641370 1242 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL5RA-206ENST00000430514 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 PNLIPRP1-221ENST00000534537 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB29-204ENST00000437324 1306 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 C8orf44-203ENST00000519561 1835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAAF4-203ENST00000448430 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNRPD2-201ENST00000342669 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms