Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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