Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms