Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBB6Q9BUF5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms