Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms