Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms