Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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