Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN18Q96SJ8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms