Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms