Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms