Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF548Q8NEK5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF548Q8NEK5 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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