Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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