Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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